Basada en la novela “Metafísica de los tubos» de Amélie Nothomb, la película cuenta la historia de Amélie, una pequeña niña, de padres belgas, nacida en Japón quien observa el mundo con una sensibilidad y curiosidad fuera de lo común. Durante su tercer cumpleaños, un suceso inesperado irrumpe en su rutina y transforma su percepción sobre todo lo que la rodea, marcando el inicio de un despertar emocional que definirá su forma de ver el mundo. En su entorno marcado por lo cotidiano y lo poético, Amélie experimentará la realidad a través de pequeños rituales y divertidos momentos en compañía de Nishio-san, la cuidadora que la acompaña en sus primeros descubrimientos en la infancia.